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Molekulare Detektion von Erregern tiefer Mykosen

Projektleiter: Volker Rickerts

Eine große Anzahl von Pilzarten ist in der Umwelt weit verbreitet. Trotz ständiger Exposition sind Menschen bei funktionierender Körperabwehr meist vor invasiven Pilzinfektionen geschützt. Dagegen können immunsupprimierte Menschen an invasiven Mykosen erkranken. Diese Infektionen können mit einer hohen Letalität einhergehen, auch weil aufgrund diagnostischer Schwierigkeiten ein Erregernachweis selten gelingt und damit eine gezielte Therapie nicht möglich ist.

Wir wenden molekularbiologische Methoden wie PCR und Sequenzierung sowie Fluoreszenz-in-situ-Hybridisierung an, um Erreger invasiver Mykosen aus Atemwegsmaterialien und Organbiopsien sensitiv nachzuweisen und im Infektionsgeschehen zu lokalisieren.

Fluoreszenz-in-situ-Hybridisierung (FISH) von Pilzen in einer gespikten bronchoalveolären Lavage (BAL). Quelle: J. Gerkrath (2016)/RKIAbb.1: Fluoreszenz-in-situ-Hybridisierung (FISH) von Pilzen in einer gespikten bronchoalveolären Lavage (BAL). Von links nach rechts: Darstellung doppelsträngiger DNA in Pilzen und Wirtszellen mit DAPI (blau), unspezifische eukaryotische Sonde (grün), spezifische Sonde für Erreger von Mucormykosen (Magenta), spezifische Sonde für Erreger von Aspergillosen (orange), Überlagerung der Einzelkanäle demonstriert die Anwesenheit verschiedener Pilze. Quelle: Jasmin Gerkrath (2016)/RKI

Die Anwendung dieser diagnostischen Tests erlaubt neue Einblicke in die Ätiologie invasiver Mykosen, die helfen können antimykotische Therapien zu optimieren und die Prognose dieser Infektionen zu verbessern.

Mitarbeiter:

  • Ilka McGormick Smith
  • Jasmin Gerkrath
  • Dunja Wilmes

Teilprojekte:

  • rRNA-FISH zur Identifizierung von Pilzen in broncho­alveolärer Lavage
  • Identifizierung von Pilzen aus Formalin-fixierten Gewebe­schnitten mit broadrange PCR und Sequenzierung
  • Molekularer Erreger­nachweis aus Sputum von Patienten mit cystischer Fibrose

Weitere Informationen

Stand: 22.03.2022

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Ausgewählte Publikationen

  • Dalimot JJ, Mc Cormick Smith I, Gerkrath J, Hartmann S, Cornely OA, Lee SC, Heitman J, Rickerts V (2022): Identification of Mucormycosis by Fluorescence In Situ Hybridization Targeting Ribosomal RNA in Tissue Samples.
    J of Fungi 8: 289. doi: 10.3390/jof8030289. mehr

  • Kessel J, Hogardt M, Aspacher L, Wichelhaus TA, Gerkrath J, Rosenow E, Springer J, Rickerts V (2022): Exclusion of Mucorales Co-Infection in a Patient with Aspergillus flavus Sinusitis by Fluorescence In Situ Hybridization (FISH).
    J. Fungi 8: 306. doi: 10.3390/jof8030306. mehr

Alle anzeigen

  • Lauerer RJ, Rosenow E, Beschorner R, Hempel J-M, Naros G, Hofmann A, Berger K, Sartor-Pfeiffer J, Mengel A, Ziemann U, Rickerts V, Feil K (2022): Rapid diagnosis of central nervous system scedosporiosis by specific quantitative polymerase chain reaction applied to formalin-fixed, paraffin-embedded tissue.
    J. Fungi 8 (1): 19. Epub 2021 Dec 27. doi: 10.3390/jof8010019. mehr

  • Wilmes D, McCormick-Smith I, Lempp C, Mayer U, Schulze AB, Theegarten D, Hartmann S, Rickerts V (2020): Detection of histoplasma DNA from tissue blocks by a specific and a broad-range real-time PCR: tools to elucidate the epidemiology of histoplasmosis.
    J. Fungi 6 (4): 319. Epub Nov 27. doi: 10.3390/jof6040319. mehr

  • Rooms I, Mugisha P, Gambichler T, Hadaschik E, Esser S, Rath PM, Haase G, Wilmes D, McCormick-Smith I, Rickerts V (2019): Disseminated emergomycosis in a person with HIV infection, Uganda.
    Emerg. Infect. Dis. 25 (9): 1750–1751. doi: 10.3201/eid2509.181234. mehr

  • Springer J, McCormick Smith I, Hartmann S, Winkelmann R, Wilmes D, Cornely O, Kessel J, Löffler J, Rickerts V (2018): Identification of Aspergillus and Mucorales in formalin-fixed, paraffin-embedded tissue samples: Comparison of specific and broad-range fungal qPCR assays
    Med. Mycol.: Epub Jun 19. doi: 10.1093/mmy/myy041. mehr

  • Brandt C, Roehmel J, Rickerts V et al. (2017): Aspergillus bronchitis in patients with cystic fibrosis
    Mycopathologia: Epub Aug 17. doi: 10.1007/s11046-017-0190-0. mehr

  • McCormick Smith I, Rickerts V (2016): Identification of fungal pathogens in tissue samples from patients with proven invasive infection by fluorescence in situ hybridization
    In: Lion T (Hrsg), Human Fungal Pathogen Identification – Methods and Protocols. Methods in Molecular Biology vol. 1508. New York: Humana Press/Springer Nature, pp. 281–288. Epub Nov 12. doi: 10.1007/978-1-4939-6515-1_16. mehr

  • Rickerts V (2016): Identification of fungal pathogens in Formalin-fixed, Paraffin-embedded tissue samples by molecular methods
    Fungal Biol. 120 (2): 279–287. Epub 2015 Jul 17. doi: 10.1016/j.funbio.2015.07.002. mehr

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