Im Fachgebiet werden humanpathogene, vorwiegend fäkal-oral übertragbare Erreger von viralen Gastroenteritiden (Calici- und Rotaviren), Hepatitisviren (HEV sowie HBV und HCV) und Enteroviren auf ihre Eigenschaften und Variabilität zum Zweck der Überwachung der Viruszirkulation mit molekular-epidemiologischen Methoden untersucht. Die Untersuchungen werden in enger Kooperation zu nationalen und internationalen Netzwerken durchgeführt.

Im Fachgebiet sind das Nationale Referenzzentrum sowie das Regionale WHO/EURO-Referenzzentrum für Poliomyelitis und Enteroviren (NRZ PE) und seit 2010 die Geschäftsstelle der Nationalen Kommission für Polioeradikation in Deutschland sowie das Konsiliarlabor für Noroviren und das Konsiliarlabor für Rotaviren angesiedelt. Die Hauptaufgaben des NRZ PE und der KLs für Noroviren und Rotaviren umfassen die Überwachung zirkulierender Viren, die Analyse der Erreger-Variabilität, die Spezialdiagnostik (z.B. Feintypisierung), die Qualitätssicherung, die Surveillance von Enteroviren sowie Untersuchungen von Ausbrüchen (in Zusammenarbeit mit Abt. 3). Diese Labore führen im Rahmen ihrer Aufgaben Beratungen, Diagnostik sowie wissenschaftliche Studien durch.

Die Arbeiten zu Hepatitisviren zielen auf die Durchführung von Spezialdiagnostik inklusive Untersuchungen zu Erregereigenschaften, zur antiviralen Resistenz sowie Fein- und Genotypisierung. Ziel ist, das Auftreten und die Dynamik der in Deutschland zirkulierenden Hepatitisviren zu erfassen, insbesondere Hepatitis E Viren (HEV), molekular-epidemiologisch zu analysieren und das von Wildtypviren und Virus-Varianten ausgehende Gefährdungspotential zu charakterisieren.

Die Konsiliarlabore für Noro- und Rotaviren sind nach der DIN EN ISO 15189 und DIN EN ISO/IEC 17025 akkreditiert. Das NRZ Poliomyelitis und Enteroviren ist nach der DIN EN ISO 15189 akkreditiert.