ZKI-PH 2: Phylogenomik

Stand:  01.04.2024

Leitung: 
Dr. Denise Kühnert
Vertretung: 
Dr. Jens-Uwe Ulrich
Robert Koch-Institut
Ludwig-Witthöft-Straße 14
15745  Wildau

Die Forschungsagenda des Fachgebietes ZKI-PH 2 „Phylogenomik“ hat ihren Fokus an der Schnittstelle zwischen Phylogenetik und Epidemiologie. Sie wird die KI-Forschung im Bereich der Analyse der Übertragungsdynamik von Infektionskrankheiten während und nach Ausbrüchen von Krankheitserregern ausbauen und KI-gestützte Modelle von Phylogenie and Verbreitung von Public Health-relevanten Krankheitserregern entwickeln. Durch die Integration historischer Pathogene werden evolutionäre Prozesse von Erregern moderner Infektionskrankheiten entschlüsselt.

Aufgaben

  • Strategische Steuerung des Ausbaus der KI-Forschung im Bereich der Analyse der Übertragungsdynamik von Infektionskrankheiten während und nach Pathogenausbrüchen
  • Entwicklung der KI-gestützten Modellierung von Phylogenie und Verbreitung von Public Health-relevanten Krankheitserregern
  • Entwicklung von Verfahren der KI-gestützten Integration von Daten aus experimentellen Hochdurchsatzverfahren für molekularbiologische oder epidemiologische Anwendungen
  • Erforschung der evolutionären Prozesse von Krankheitserregern durch Integration von hunderte bis tausende Jahre alter Pathogene in phylogenomische Untersuchungen